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[沉香树]分析豆类中沉香树属SSR标记的多功能性发布日期:2019-06-10 19:55:51
  在10个豌豆品种蚕豆21对基因组SSR引物的通用性进行了分析。果表明,SSR引物在沉香树bean的基因组中的多功能性为38.10%和豆类品种的有效多态性引物为100%。键词:豌豆;蚕豆; SSR;多功能数字CLC:S643文献标识码:A文章编号:0439-8114(2012)中HorsebeanHOU万伟,刘玉jiaoAbstract01-0185-03Traductibilité豌豆SSR标记:的21对可移植性测试了僧侣(Vicia faba)中豌豆(Pisum sativum)的SSR标记。果表明,在马豌豆SSR转移性率为38.10%,有效率为SSR多态性在马率为100%。键词:豌豆(豌豆),沉香树豆(蚕豆),SSR,便携性,简单序列重复(SSR),序列图案由1个6个碱基。DNA序列,广泛存在于真核细胞的基因组中,具有[1]图案的两端相对保守的单拷贝序列。其它分子标记相比,SSR标记被广泛用于基因定位,品种鉴定,并伴有大量数字,等位变异,共显性遗传,高再现性和良好的覆盖的特征在于基因组。
  图构建,种子纯度检测和遗传多样性分析[2-6]。SSR引物可通过三种方式获得:一个是看在公共数据库(GenBank中),另一种是筛选基因组文库微卫星序列的序列,其他的获得对从相关物种设计的引物[7]。了减少SSR引物的开发成本,许多研究人员对SSR引物,从不同种和属多功能性,在最近几年[8-16]进行了广泛的研究。这项研究中,多功能性和21对放入豌豆豆基因组SSR引物的多态性,以迅速确定遗传多样性和分子标记辅助选择标记蚕豆的分析进行了研究。子标记。料和方法。1种材料测试豆品种研究为:青海9号,第11号青海,青海第12号,我的牙齿灵溪一英寸,F d,绿色半透明,双“0”,食品,130 21 ZONG等人报道了沉香树的SSR引物对(表1)。[17]由上海圣工生物工程技术服务有限公司合成。2 DNA提取和SSR分析。2.1 DNA提取豆的基因组取约1g年轻的豆叶,加入液氮​​到粉末,并添加0.8 DNA提取缓冲液[100毫摩尔/ L的Tris(pH值8.0) 150毫摩尔/ L EDTA(pH 8.0)中2.1 摩尔/ L的NaCl 2%CTAB 2%PVP]在离心管1.5毫升,加入65浴中的溶液在12 000转/分钟拌匀,离心10分钟,将上清转移到另一离心管中,并添加等体积:浴45分钟,加入氯仿的等体积/异戊醇(1 24体积比)无水乙醇。

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  在冰上放置20分钟,在10 000转/分钟离心5分钟,弃去上清液,用75%乙醇清洗沉淀3次,在空气中干燥,加入400微升的TE中为溶解并储存在-20°C以备后用。2.2 PCR反应和SSR反应体系,为产品检测(20微升),包括Mg2 的2微升,10×缓冲液2微升,Taq DNA聚合酶1 U,的dNTP,各200微摩尔/ L和10摩尔/ L 2μL引物,模板DNA 200 ng。应程序如下:在94℃下预变性5分钟,在变性94℃1分钟,退火1分钟(从1℃到60℃),延伸在72℃下2分钟,10个循环,在94℃下变性1分钟,50复性℃下1分钟,延伸72℃,2分钟,22个循环,延伸在72℃10分钟,在4℃保存C. 5溴酚蓝的微升加入到扩增产物和5微升物在6%非变性在200V进行90分钟进行在聚丙烯酰胺凝胶电泳。泳后,将凝胶用蒸馏水漂洗两次,加入染色液15分钟(0.2%的AgNO 3 1%冰醋酸的无水乙醇 10%),然后用清水冲洗两次用蒸馏水,加入显影剂(1.5%NaOH 0)。

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  发0.5%甲醛)并记录和分析结果。果和分析。1 SSR引物在沉香树bean的基因组中的多功能性共8对SSR的引物沉香树(PB14,PSAA18,PSAD83,PSAA456,PSAD280,PSAB109,AD100,AA303)可以完全稳定地在扩增豆基因组DNA,代表38. 10%。对这些通用SSR引物属于第七连接基团(LG VII)中,两对第二连接基团(LG II),和一对第五连接基团(LG V)组成。些通用的SSR标记的片段可相对保守的基因组中的部分和未发生遗传分化,也可能的是,两个物种都受到进化过程中一个共同的选择压力。2个品种豆的多态性SSR通用引物,通过使用通用引物对10个豆品种8基因组DNA扩增(图1)。果表明,8对引物有一个多态性和多态性。别比例是100%。
  些多态性引物的等位基因变体的数量为3〜10,平均为8种等位基因变异引物对。些引物富含豆类多态性,可用于豆类资源的遗传分析。论有关于流派[8-17]中的物种,甚至不同流派之间的SSR分子标记的通用性报道很多。子标记的使用SSR的普遍性可以改善分子标记的开发效率,降低开发成本,扩大marqueurs.Cest数量植物种质资源的研究,特别是高密度遗传图谱和遗传物质资源的收集,保存和评估。有这些都有重要意义。亲属利用SSR引物是当一个特定情况下的基因组信息的不完全理解一个非常方便的方式。该研究中,获得了沉香树和蚕豆之间的8对多价SSR标记。

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  们不仅可以为遗传多样性,基因的发现,识别,豆种质资源分子标记辅助选择,分析,而且豆绉桃金娘一起使用。较基因组学研究的有效工具。
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